高效液相色谱仪系统由进样器、色谱柱、储液器、泵、检测器、记录仪等组成。
储层中的流动相由高压泵泵入系统。样品溶液通过进样器进入流动相，装入色谱柱（固定相）。由于两相样品溶液中各组分的分布系数不同，在两相中相对移动时要经历多次吸附解析分布过程，各组分的移动速度差异较大，它被分离成单个组件，并依次流出列。样品浓度通过检测器时，转换成电信号传送给记录仪，数据以地图的形式打印出来。
高效液相色谱法在医学领域有作用吗？
1.药品生产中的中间控制：在生产抗生素时，首先要了解发酵液中存在的主体和副产物。如头孢菌素、红霉素、青霉素、四环素、柔红霉素和庆大霉素的发酵产物可采用C18柱、甲醇和缓冲液制备流动相或离子对法进行分析。
2.药物成分含量的分离分析：由于药物通常含有多种成分，所以维生素B6、维生素D1、维生素a、维生素E可以同时分离测定。例如，止痛药或退热药也可以用这种方法分离，并可以测定各成分的含量。
3.测定各器官中药物的代谢产物：特别是研究血清中药物代谢产物的存在。
4.药物体内残留分析：这是近年来新药研究的主要内容之一。如冬凌草素是植物的一种成分，具有抗癌作用，但毒性很大。
离子色谱法的优点
离子色谱法具有快速、灵敏、选择性好、多组分同时测定的优点，其中许多组分是其他方法难以测定的，特别是阴离子。离子色谱法分析阴离子是分析化学的一个新突破。如果高频电感耦合等离子体原子发射光谱－质谱联用（ICP - MS）是一种快速、灵敏、准确同时测定多种元素的分析方法，离子色谱法应是第一种快速、灵敏、准确同时测定多种阴离子的分析方法。